其一，印染废水中存在复杂度比较高的物质，水质会产生大范围波动，并且处理方法单一，加大污染物去除难度。

　　其二，印染废水具有较弱可生化性，要确保废水达标，仅仅应用传统生物法必定无法实现。近年来，我国印染技术飞速发展，在印染废水中出现众多降解难度大的有机物，提高所用燃料的稳定性，不仅抗氧化而且抗还原。此外，多种生物毒性强的有机物存在废水中，比如助剂、金属离子等，导致废水可生化性更差。

　　其三，目前应用的处理工艺有所限制，并且处理成本高。我国印染废水在20世纪80年代之前具有较高可生化性，一般化学需氧量小于800㎎/L，通过传统生物及物化联合系统的应用，能够使出水排放达标。印染废水水体质量在最近二十年中变化比较大。过滤、吸附及悬浮等都是传统印染废水处理方法，一般这些方法在转化有机物时，可以使其从液相转为固相，也可以转为气相，但是并未将污染物全部去除，且产生二次污染。如果应用生物法，仅仅可以去除生化需氧量，不可有效去除毒性强且降解难度大的污染物。